Frutto della cultura scientifica napoletana che dalla seconda metà del Seicento primeggia in Europa, i Musei scientifici universitari non sono una istituzione recente nella storia dell'Università Federico II: furono fondati tra i primi anni e la fine del secolo scorso e sono giunti a noi, preziosa testimonianza di una lunga tradizione culturale grazie alla lungimiranza di pochi uomini di cultura a cui va il merito di avere difeso le collezioni e gli storici locali che le ospitavano.